สาเหตุเบื้องต้นจากการลงพื้นที่ของสำนักงานเจ้าท่าภูมิภาคสาขาภูเก็ต ในการตรวจสอบข้อเท็จจริงของเจ้าหน้าที่และจากการให้การของตัวแทนเจ้าของคานเรือสิกิจได้ให้การว่า ในเวลา 10.00 น. คานเรือสิกิจได้ประสานให้เรือ ชื่อโจวาน่า หมายเลขทะเบียนเรือ 665103217 (เรือยังไม่สิ้นอายุ) มาทดลองขึ้นคาน เพื่อซ่อมทำสีและปรับปรุงภายในตัวเรือ แต่เนื่องจากขณะนำเรือทดลองขึ้นคาน ประกอบกับเป็นช่วงเวลาน้ำขึ้นทำให้ผู้ควบคุมเรือต้องเร่งเครื่อง และประคองไม่ให้เรือลำดังกล่าวลื่นไถลไปโดนเรืออื่นที่จอดอยู่บริเวณใกล้เคียง
จึงเป็นเหตุให้เกิดคราบเขม่าควันกระจายบนผิวน้ำบริเวณดังกล่าวเป็นจำนวนมาก ทั้งนี้ เรือลำดังกล่าวไม่สามารถนำขึ้นคานเรือสิกิจได้ เนื่องจากท้องเรือมีลักษณะไม่เหมาะกับสาลี่ของคานเรือสิกิจ ทั้งนี้ สำนักงานเจ้าท่าฯจะเชิญเจ้าของเรือ ผู้ควบคุมเรือให้การอีกครั้ง พิจารณามีคำสั่งงดใช้เรือ ให้แก้ไขให้เรียบร้อยก่อนและดำเนินการในส่วนที่เกี่ยวข้องต่อไป
